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在分子生物學領域,簡并引物是常用的實驗工具。那么簡并引物中的簡并度是什么意思呢?簡并度是簡并引物的一個關鍵概念。簡單來說,簡并度反映了引物中堿基序列的復雜程度。由于遺傳密碼存在簡并性,不同的密碼子可能編碼同一種氨基酸,當根據氨基酸序列設計引物時,就會出現多種可能的堿基組合,這些組合的數量體現了簡并度。了解簡并度對于設計高效、特異性強的簡并引物至關重要,它直接影響著后續實驗如 PCR 擴增等的結果。接下來,我們就深入探討簡并度的相關知識。
1、就是簡并堿基的乘積。比如aaggtt(a/c/g)tt(t/a)ggt(g/c)括號里面的是簡并堿基,乘積是3*2*2=12簡并度就是12。
2、簡并引物是指代表編碼單個氨基酸所有不同堿基序列可能性引物的混合物。PCR為了增加特異性,可以參考密碼子使用表,根據不同生物的堿基使用偏好,減少簡并性。簡并度越低,產物特異性越強,設計引物時應盡量選擇簡并性小的氨基酸,并避免引物3’末端簡并。
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